En bovinos, «Conciliar con HI-Tier» contrasta su censo en una fecha de referencia con el que HI-Tier lleva para su explotación y muestra los animales que figuran solo en un lado o con datos discrepantes; con cotejo automático se ejecuta cada semana por sí mismo, y no se notifica nada. Al recuperar los datos, FarmManager adopta el estado de HI-Tier; si HI-Tier lleva la misma entrada con otros valores, valen los valores de HI-Tier. Si HI-Tier rechaza una notificación, falla una transmisión o una consulta, o falta una autorización, FarmManager crea una entrada con su nivel de gravedad. Si un bovino que FarmManager notifica ya está registrado en HI-Tier con otros datos, la entrada indica los datos discrepantes.